腺伴隨病毒PCR試劑盒的PCR反應(yīng)條件設(shè)置:
a)預(yù)變性:95℃,5 min可以讓白細(xì)胞裂解,釋放可用于PCR擴(kuò)增的基因組DNA。請勿縮短時(shí)間或降低溫度。
b)退火溫度:退火溫度設(shè)置為引物Tm值即可。然而,使用高的退火溫度可以有效減少非特異性擴(kuò)增,并提高全血模板的擴(kuò)增效率。因此,如擴(kuò)增產(chǎn)物特異性較差,可以建立一個(gè)溫度梯度反應(yīng)去尋找引物模板zui適退火溫度。
c)延伸時(shí)間:按30 sec/kb設(shè)定,如不足30 sec,設(shè)置30 sec即可。
d)擴(kuò)增循環(huán)數(shù):35個(gè)循環(huán)已可以擴(kuò)增足量產(chǎn)物。太多的循環(huán)將會(huì)導(dǎo)致非特異性擴(kuò)增增加。
PCR完成后,建議將反應(yīng)液于000× g (大約4000 rpm) 離心~3 min以沉淀血細(xì)胞碎片,之后取上清進(jìn)行下游分析。該步驟可有效去除多種血液組分。當(dāng)使用高濃度血液模板時(shí)此步尤為重要,因?yàn)榻?jīng)過PCR循環(huán),反應(yīng)管中會(huì)存在大量的血細(xì)胞碎片。這些碎片會(huì)干擾下游的檢測,如瓊脂糖電泳檢測。注意:由于血液本身的原因,PCR 結(jié)束后在 PCR 管的底部會(huì)出現(xiàn)透明凝膠狀物質(zhì),此為正常現(xiàn)象。